Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CEP44Q9C0F1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms