Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms