Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDEM3Q9BZQ6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms