Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRNKL1Q9BZJ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms