Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAGE1-201ENST00000381700 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP9-9-201ENST00000394008 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL390835.1-201ENST00000413941 901 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABGAP1L-IT1-201ENST00000414890 737 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL049648.1-201ENST00000443692 282 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2D4-206ENST00000446008 783 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LLPH-202ENST00000446587 1177 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008677.3-201ENST00000519146 666 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087393.2-201ENST00000580962 504 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359834.1-201ENST00000635660 638 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL390728.4-201ENST00000421406 1465 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP9-8-201ENST00000254072 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133343.1-201ENST00000375670 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF816-ZNF321P-201ENST00000391777 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms