Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms