Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2Q9BX26 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms