Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf16Q9BUW7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms