Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms