Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC5LQ99459 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC5LQ99459 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms