Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSF3RQ99062 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSF3RQ99062 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms