Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CICQ96RK0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms