Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX18Q96RF0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX18Q96RF0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms