Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
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