Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5RAP3Q96JB5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms