Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG3Q96JB2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms