Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms