Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BORCS6Q96GS4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BORCS6Q96GS4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms