Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MTERF3Q96E29 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms