Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms