Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIEQ8NEW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms