Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL3Q8ND23 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARMIL3Q8ND23 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms