Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms