Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS8Q8N3P4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS8Q8N3P4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms