Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNE4Q8N205 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms