Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC47Q8N1G4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms