Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNTD2Q8IXW0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms