Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms