Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms