Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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