Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms