Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY3Q7L099 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms