Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNDC1Q76NI1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNDC1Q76NI1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms