Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HECW1Q76N89 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms