Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PREX2Q70Z35 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 5291.2 ms