Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP31Q70CQ4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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