Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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