Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL4Q6XD76 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL4Q6XD76 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms