Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FOXD4L3Q6VB84 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4L3Q6VB84 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms