Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC12Q6PEW1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms