Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KANK3Q6NY19 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms