Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNP1Q6NT89 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms