Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USPL1Q5W0Q7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms