Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms