Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRIP1Q5VSL9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRIP1Q5VSL9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms