Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOGA3Q5TF21 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms