Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LGSNQ5TDP6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGSNQ5TDP6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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