Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf220Q5T0J3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf220Q5T0J3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms