Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
BRMS1LQ5PSV4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BRMS1LQ5PSV4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BRMS1LQ5PSV4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms