Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WDR44Q5JSH3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms